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環(huán)境學(xué)院已有30多年的辦學(xué)歷史，前身可追溯到1978年經(jīng)水利部批準(zhǔn)設(shè)立的環(huán)境水利科學(xué)研究所。1986年在農(nóng)田水利系招收環(huán)境工程專業(yè)本科生，1988年成立環(huán)境工程系，1994年成立環(huán)境科學(xué)及工程學(xué)院，1995年與水資源水文系合并成立水文水資源及環(huán)境學(xué)院，2002年獨(dú)立設(shè)置環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院，2009年更名為環(huán)境學(xué)院。學(xué)院設(shè)有環(huán)境工程系、環(huán)境科學(xué)系、環(huán)境生態(tài)工程系、市政工程系、化學(xué)中心、水資源保護(hù)與生態(tài)修復(fù)研究所、現(xiàn)代水處理技術(shù)研究所、水環(huán)境模擬與生態(tài)水力學(xué)研究所、環(huán)境規(guī)劃與評價研究所、固體廢棄物處理及資源化循環(huán)利用研究所、環(huán)境化學(xué)研究所、水污染控制研究所、污水資源化與低碳發(fā)展技術(shù)研究所、環(huán)境微生物研究所、環(huán)境水利科學(xué)研究所、實(shí)驗(yàn)中心等機(jī)構(gòu)，建設(shè)項目環(huán)境影響評價資質(zhì)證書（甲級）。淺水湖泊綜合治理與資源開發(fā)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室掛靠我院建設(shè)與管理。2018年，河海大學(xué)環(huán)境新材料研究中心、河海大學(xué)農(nóng)田污染防控研究中心成立并掛靠學(xué)院建設(shè)管理。2019年，江蘇省城鄉(xiāng)飲用水安全保障工程研究中心成立并掛靠學(xué)院建設(shè)管理。

學(xué)院的環(huán)境工程為國家重點(diǎn)（培育）學(xué)科和江蘇省重點(diǎn)學(xué)科，環(huán)境科學(xué)與工程為江蘇省重點(diǎn)學(xué)科。環(huán)境科學(xué)與工程一級學(xué)科在最新全國學(xué)科評估中排名第七，并入選江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)項目。設(shè)有5個本科專業(yè)、4個碩士學(xué)位授予權(quán)、1個一級學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)、4個二級學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)，設(shè)有環(huán)境科學(xué)與工程一級學(xué)科博士后流動站。目前，在校本科生1200余名，博士、碩士研究生500余名，外國留學(xué)生90余名。

全院現(xiàn)有教職工94名，其中：中國工程院院士1名。學(xué)院現(xiàn)有教授30名，副教授（含副研究員）31名。擁有博士生導(dǎo)師27名、碩士生導(dǎo)師40名，專任教師中具有博士學(xué)位比例100%。學(xué)院形成了可持續(xù)發(fā)展的學(xué)術(shù)團(tuán)隊，現(xiàn)有國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體1個，教育部、江蘇省創(chuàng)新團(tuán)隊3個。

近五年來，學(xué)院深入開展學(xué)科建設(shè)、教育教學(xué)改革和科學(xué)研究，形成以水資源保護(hù)、生態(tài)修復(fù)、水污染治理、飲用水安全、環(huán)境評價、固體廢棄物處理等為特色的科學(xué)研究、技術(shù)開發(fā)、人才培養(yǎng)和觀測實(shí)驗(yàn)基地。學(xué)院先后承擔(dān)了國家973、863、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目、國家重大水專項和省部級直接服務(wù)于國家經(jīng)濟(jì)建設(shè)的重大科研任務(wù)等200余項。部分研究成果處于國際先進(jìn)和國內(nèi)領(lǐng)先水平，獲得包括國家科技進(jìn)步一等獎、國家自然科學(xué)二等獎、國家技術(shù)發(fā)明二等獎、國家科技進(jìn)步二等獎等國家級、省部級以上科技獎勵40余項，出版專著與教材30余部。學(xué)院年均科研經(jīng)費(fèi)4000余萬元，發(fā)表SCI檢索論文100余篇，獲得國家專利40余項。目前，環(huán)境學(xué)院正以良好的態(tài)勢迅猛發(fā)展，在國內(nèi)外具有鮮明的學(xué)科優(yōu)勢和廣泛影響。