湖南大學教育學科歷史悠久，早在1929年省立湖南大學期間就設立了教育系，出版了《教育叢刊》。新中國成立后，1949年湖南大學成立了教育學院。1953年院系調(diào)整時，教育學科調(diào)離湖南大學。直至1981建立高等教育研究室，恢復教育科學研究，1987年更名為高等教育研究所，2006年正式成立教育科學研究院。
學院于1998年設立“高等教育學”碩士學位授予點，是湖南省最早設立的高等教育學碩士學位授權(quán)點之一。2003年設立“教育經(jīng)濟與管理”碩士學位授權(quán)點，2005年設立“教育學”一級學科碩士學位授權(quán)點，2007年設立“教育碩士”專業(yè)學位授權(quán)點，是綜合性大學中第一批具備招收教育碩士專業(yè)學位資格的單位。2013年正式通過了“教育管理學”二級學科博士點授權(quán)資格。
學院集人才培養(yǎng)、科學研究、咨詢服務和教育理論刊物出版于一體。學院設有“湖南省教育評價研究中心”、“湖南省少年兒童組織與思想意識教育研究中心”等省級研究中心，是湖南省首批高等教育研究基地之一。“湖南省高等教育學會秘書處”掛靠我院，學會日常工作由本院負責。目前，設有教育學原理、課程與教學論、高等教育學、教育經(jīng)濟與管理等二級學科方向，在教育質(zhì)量與評價、有效教學、教師教育、高等教育管理、大學分層與定位等方向形成了研究特色和優(yōu)勢。院資料室擁有人文、教育等領域中外藏書19657萬冊和中外文期刊99種。本院主編的教育類學術刊物《大學教育科學》屬CSSCI來源期刊和《中文核心期刊》。
學院自1999年開始招收碩士研究生，現(xiàn)有在讀碩士研究生204人，其中，“教育學”一級學科研究生39人；“教育經(jīng)濟與管理”二級學科研究生45人；留學研究生5人；“教育碩士”（教育管理方向）專業(yè)學位研究生115人?，F(xiàn)有教職員工21人，其中，專任教師14人，編輯等專業(yè)技術人員3人，行政管理及學生輔導員4人。專任教師中博士畢業(yè)比例達100%，海外經(jīng)歷一年及以上教師近50%。另聘有校內(nèi)外兼職教師20余人。
目前，學院正依托湖南大學“千年學府，百年名校”深厚的文化底蘊和學科優(yōu)勢，努力探索綜合性大學教育學科發(fā)展的新模式。今后一個時期，學院將以服務學校為宗旨，以人才培養(yǎng)質(zhì)量為核心，以凝練隊伍、打造特色、提高水平為關鍵，內(nèi)強筋骨，外樹形象，全面提高人才培養(yǎng)質(zhì)量、科研實力和咨詢服務能力，努力使本院成為有特色、高水平、開放式的研究型學院。
